高通量声波基因组剪切仪通过高频超声波产生的瞬时剪切力,应用等温、非接触地方式对DNA样本进行片段化;高通量超声波基因组剪切仪对样品的处理具有通量高、操作灵活简便、无样品间的交叉污染、重复性好、实验效率高等性能特点。它被广泛用于对细菌细胞破碎、蛋白质抽提、二代测序样本DNA片段化、免疫共沉淀实验等方面。
在医疗应用领域,靶向治疗和免疫治疗的应用越来越广泛,通过伴随诊断试剂检测合适的生物标志物,筛选出对药物疗效更加敏感的患者,可以使患者在临床诊疗得到更加精准的治疗。因此,基于高通量测序方法进行伴随诊断试剂检测的产品也日益增多。
声波基因组剪切仪在高通量测序方法中的实验应用方案:
1.采集样本并对样本进行核酸抽提
2.DNA文库构建
①样本准备:基因组DNA片段化
②末端修复和连接
③Pre-PCR
④杂交和杂交洗脱
⑤Post-PCR
3.测序上机
4.数据分析和药物靶向位点筛选
DNA片段化的案例展示:
DNA片段化结果图案例1
DNA片段化结果图案例2
高通量测序技术的应用具有高准确度、高通量、高自动化等应用优势,且随着技术不断改进,测序读长和测序深度也在不断的增加,其在医学领域的应用也日渐广泛。高通量声波基因组剪切仪可以通过可调的超声功率与工作时间去适应不同上机要求的片段长度。
声波基因组剪切仪用于NGS测序的优势:
①通量高:一次可同时处理多个组织样品,实验效率高
②无需频繁操作探头:各样品均在单独的全封闭试管中,避免了交叉污染,不产生感染性飞雾,不需要额外插入超声探头
③可避免样品的变性:采用4℃低温水浴超声波,能量分布均匀,超声作用完全,样品完全在低温环境中进行,避免了样品的变性
④样本破碎方式:利用磁致伸缩共振超声技术破碎样本,多种超声频率同时工作,能量输出均衡,超声密度均一,非接触处理,确保实验效果一致性好