非接触超声波DNA打断仪助力生物样本DNA的超声打断|杭州联川生物

实验目的:生物DNA样本组织的超声打断;对于一些动植物组织样本的实验检测,需要将其打断到200~300bp,再进行后续的实验测序分析。

实验客户:杭州联川生物技术股份有限公司,主要提供二代测序科技服务、高通量芯片表达谱分析、大数据生物信息分析及软件、高通量寡核苷酸合成、分子生物学与临床检测试剂,以及VariantPro靶向文库制备系统。

实验设备:非接触超声波DNA打断仪XM-150A双通道

实验操作步骤:

1.准备XM-150A单槽一台,冷水机一台,0.1ml适配器一个,0.1ml离心管若干,需打断的dna样本若干

2.将适配器放入水槽,打开冷水机预冷至4度

3.将稀释好的dna样本每样100微升放入0.65ml的离心管盖盖编号,震荡离心

4.将dna样本放入适配器(注意平面配平,尽量将样品放置在适配器外圈,内圈同一样本重复放置两个进行对比)

5.能量设置100%,工作20s间隙10s循环工作,总时长14min

6.工作完成后重复样本取出一个,另一重复样本继续能量设置100%,工作20s间隙10s循环工作,总时长3min

7.样本全部取出,进行后续跑胶测试

样本准备:

样品处理完成

样品实验跑胶结果:

左侧为打断总时长为14min的样品,前两个为外圈样品;右侧为打断总时长为17min的样品,前两个为外圈样品

为更好地解决老师样本内外圈打断不均一的实验问题;此次实验更换调整了仪器内的纯水,设置了不同时长的变量,对结果并无明显影响,后续考虑再次测试仪器内水位高低对样品打断结果的影响。

实验操作注意事项:

1.样本的体积注意不能过多,导致仪器内水位不能完全没过样品。

2.适配器需要配平,不能让适配器压盖有所倾斜,导致样本开盖污染。

3.同等条件下人体dna打断难度大于小鼠大于植物,需要根据样本调整仪器工作总时长

4.冷水机需要提前打开预冷

5.水流循环要调整稳定不能过于激烈

非接触超声波细胞破碎仪助力细胞样品的实验研究
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