小美超声波打断仪:FFPE和全血gDNA样本的超声打断测试结果

实验条件
  
1.仪器型号:小美超声打断仪、光鼎Qsep1全自动核酸蛋白分析系统
  
2.小美打断仪样品条件设置:功率100%;周期打20s停10s;0.2mL离心管,样本投入量300ng(50ul)
  
3.Qsep1核酸蛋白分析系统条件设置:S1高分辨率卡夹;20-1Kbp内参marker;26-622bp size marker;8kv分离电压
  
4.样本类型:FFPE和全血 gDNA超声打断样本

非接触超声波DNA打断仪

非接触超声波DNA打断仪

需要将客户提供的FFPE gDNA样本打断到350bp(主峰)
  
在小美打断仪上设置三个打断时间梯度:20min、15min、10min,打断后的样本通过Qsep质控片段分布,最后确定打断时间10min比较合适。
  
在10min打断时间的条件下,打断剩余9个FFPE gDNA样本,每个样本做两个重复,具体结果如下:
  
FFPE gDNA原始样本(打断前)

FFPE-打断20min

FFPE-打断15min

FFPE-打断10min

FFPE2-1

FFPE2-2

FFPE2重复性

FFPE3-1

FFPE3-2

FFPE3重复性

FFPE9-1

FFPE9-2

FFPE9重复性

FFPE12-1

FFPE12-2

FFPE12重复性

FFPE29-1

FFPE29-2

FFPE29重复性

FFPE30-1

FFPE30-2

FFPE30重复性

FFPE32-1

FFPE32-2

FFPE32重复性

FFPE33-1

FFPE33-2

FFPE33重复性

FFPE36-1

FFPE36-2

FFPE36重复性

需要将客户提供的全血 gDNA样本打断到350bp(主峰)

在小美打断仪上设置四个打断时间梯度:15min、12min、11min、10min ,打断后的样本通过Qsep质控片段分布,最后确定打断时间11min比较合适。
  
在11min打断时间的条件下,打断剩余1个全血 gDNA样本,每个样本做两个重复,具体结果如下:
  
全血 gDNA原始样本(打断前)

血-打断15min

血-打断12min

血-打断11min

血-打断10min

血HNZ-1

血HNZ-2

血HNZ重复性

非接触DNA打断仪|全基因组DNA样品的超声打断
« 上一篇 2025年3月3日 下午3:53