实验目的:将全基因组DNA样品进行100-500bp区间的片段化处理。
实验仪器及材料:
1.实验仪器:小美超声-高通量超声波基因组剪切仪
2.实验材料:核酸浓度为12ng/μL的全基因组DNA溶液

基因组样品DNA超声打断的实验步骤:
1.提前15分钟将三款仪器的冷水机启动,设置温度为4℃。
2.将每个0.2mL EP管加入130 μL 浓度为12ng/μL的全基因组DNA溶液。
3.将2管装好样品的0.2mL EP 管分别放入仪器的适配器当中,其他空余的孔位由加同样体积水的0.2mL EP 管补齐。
4.程序设置:温度4℃,超声工作时间20s间隔时间10s,总时长分别为3分钟和4分钟。
5.程序结束后,取出样品使用毛细管电泳进行基因组片段化检测。
基因组样品DNA超声打断的实验结果:
1.小美超声-高通量超声波基因组剪切仪 程序一:
①程序设置:温度4℃,超声工作时间20s 间隔时间10s,总时长3分钟
平均片段大小:288 bp, 101-503 bp区间占比 83.64%。

2.小美超声-高通量声波基因组剪切仪 程序二:
②程序设置:温度4℃,超声工作时间20s 间隔10s,总时长4分钟
平均片段大小:266 bp,99-503 bp区间占比 89.33%。

3.实验结果汇总:
在样品、超声程序设定等条件相同的情况下,使用小美超声的高通量声波基因组剪切仪在3分钟和4分钟时,100-500 bp区间占比分别为83.64%和89.33%,且二者峰图呈平缓状,表明基因组片段均一性良好。