非接触式超声波DNA打断仪助力唯可生物基因组样品的前处理

  实验目的:将全基因组DNA样品进行100-500bp区间的片段化处理。
  
  实验仪器及材料
  
  1.实验仪器:小美超声-高通量超声波基因组剪切仪
  
  2.实验材料:核酸浓度为12ng/μL的全基因组DNA溶液

  基因组样品DNA超声打断的实验步骤:
  
  1.提前15分钟将三款仪器的冷水机启动,设置温度为4℃。
  
  2.将每个0.2mL EP管加入130 μL 浓度为12ng/μL的全基因组DNA溶液。
  
  3.将2管装好样品的0.2mL EP 管分别放入仪器的适配器当中,其他空余的孔位由加同样体积水的0.2mL EP 管补齐。
  
  4.程序设置:温度4℃,超声工作时间20s间隔时间10s,总时长分别为3分钟和4分钟。
  
  5.程序结束后,取出样品使用毛细管电泳进行基因组片段化检测。
  
  基因组样品DNA超声打断的实验结果:
  
  1.小美超声-高通量超声波基因组剪切仪 程序一:
  
  ①程序设置:温度4℃,超声工作时间20s 间隔时间10s,总时长3分钟
  
  平均片段大小:288 bp, 101-503 bp区间占比 83.64%。

  2.小美超声-高通量声波基因组剪切仪 程序二:
  
  ②程序设置:温度4℃,超声工作时间20s 间隔10s,总时长4分钟
  
  平均片段大小:266 bp,99-503 bp区间占比 89.33%。

  3.实验结果汇总:
  
  在样品、超声程序设定等条件相同的情况下,使用小美超声的高通量声波基因组剪切仪在3分钟和4分钟时,100-500 bp区间占比分别为83.64%和89.33%,且二者峰图呈平缓状,表明基因组片段均一性良好。

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